La jugabilidad modifica las estadísticas del personaje del jugador, proporcionándole o modificando habilidades, entre otras cosas. Los objetos en general están clasificados en un número distinto de tipos y grupos. Algunos son pasivos, que añaden un efecto permanente en el jugador, mientras otros se tienen que activar.
Los objetos que estén tirados en The Binding of Isaac NUNCA desaparecen con el tiempo; una moneda tirada se quedará ahí hasta que la recojas o salgas del nivel. Un objeto tirado puede dejarse en su lugar para recogerlo después.
